免疫机制是战斗系统的核心策略之一，掌握免疫技能的使用时机和搭配方式能显著提升实战表现。免疫效果主要分为忍术免疫、状态免疫和技能打断免疫三类，其中忍术免疫可抵御敌方忍术伤害，状态免疫能避免被施加负面效果，而技能打断免疫则保障自身奥义或关键技能的顺利释放。合理利用这些免疫特性，可以在对抗高爆发或控制型阵容时占据优势。需不同忍者的免疫能力存在差异，部分角色如带土十尾人柱力天生具备忍术封印和免疫效果，而阿修罗等忍者则专精于特定状态的免疫。
免疫能力的获取途径多样，除忍者固有特性外，还可通过装备、忍具和通灵兽进行补充。装备系统中的特定套装能提供忍术抗性或异常状态抵抗，高阶忍具往往附带免疫触发的被动效果，而通灵兽如蛞蝓的群体治疗也能间接增强团队生存能力。在资源有限的情况下，建议优先培养主力角色的免疫属性，尤其是针对当前竞技环境中主流阵容的克制方向。例如面对以火属性为主的队伍时，叠加火抗性装备比泛用性防御更有效。
战斗中的免疫策略需要结合敌方阵容动态调整。面对奥义爆发型对手时，保留替身术或霸体秘卷用于关键回合；遭遇持续控制队伍时，则需提前部署状态免疫忍者。部分高阶技巧包括预判敌方奥义释放时机，利用无敌帧规避伤害，或是通过走位诱导对方交出关键技能后再开启免疫效果。团队搭配方面，建议将免疫型忍者置于后排保护核心输出，同时注意避免免疫效果重复覆盖导致资源浪费。
忍者技能的联动能进一步放大免疫效果。例如宇智波鼬晓的奥义具备反射不良状态特性，与罗砂等提供护盾的忍者配合可形成攻防一体的体系；奇拉比作为唯一能为队友提供技能免疫打断的忍者，在保护蓄力型角色时具有不可替代性。这种协同效应不仅体现在技能组合上，也反映在追打连击的节奏把控中，通过精确计算查克拉消耗和冷却时间，可实现免疫链的全程覆盖。
